معاونت امور بهداشتی دانشگاه از خرداد ماه سال 1373 به دنبال ادغام سازمان منطقه های بهداشت و درمان و دانشگاه فعالیت خود را آغاز نمود تا وظیفه اصلی خود را در قالب مدیریت دانشگاه به صورت ایجاد پل ارتباطی بین جامعه و نیازهای بهداشتی و درمانی از یك طرف و نقش آموزش مبتنی بر جامعه در دانشگاه از سوی دیگر و انجام پژوهشهای كاربردی به انجام رساند. پس از ادغام، به دلیل فراوانی و گستردگی گیرندگان و تنوع و ویژگیهای خدمات بهداشتی، همچنین سهولت ارائه خدمات ساختار تشكیلات و وظایف معاونت بهداشتی در قالب مركز بهداشت استان طراحی و ابلاغ گردید.
معاونت بهداشت بر اساس شرح وظائف پیش بینی شده در سیستم بهداشتی (با مدیریت معاون امور بهداشتی) در قالب 10 واحد ستادی به امر برنامه ریزی، هدایت، نظارت، سازماندهی و ارزشیابی برنامه ها در سطح مراكز بهداشت شهرستانها (باهماهنگی و همكاری سایر معاونتهای دانشگاه) میپردازد.این معاونت علاوه بر ارتباط با ریاست دانشگاه و سایر معاونتهای مربوطه به طور مستقیم با ادارات كل معاونت بهداشت وزارت بهداشت، درمان و آموزش پــزشكی در ارتباط میباشد و از سوی آنها پشتیبانی (علمی، مالی و ...) هدایت و نظارت و سازماندهی میگردد.
محدوده دانشگاه شهید بهشتی از شمال به استان مازندران، از جنوب به محدوده دانشگاه علوم پزشکی تهران، از خاور به استان سمنان و از باختر به محدوده دانشگاه علوم پزشکی ایران میباشد. این منطقه بین 34 تا 5/36 درجه عرض شمالی و 50 تا 53 درجه طول خاوری واقع شده و با رشته كوههای البرز از استانهای شمالی ایران جدا شده است. درارتفاعات بالایی كوهستان البرز كه دارای شیب نسبتا تندی است، جمعیت اندکی ساكنند و شهرستان دماوند دراین ارتفاعات واقع شده است .
مناطق شهرداری تابعه به تفكیك شامل مناطق 1 (مركزبهداشت شمیرانات)،3 و4 و7 و8(مركزبهداشت شمال تهران)، 12و13و14و قسمتی از منطقه 15 (مركزبهداشت شرق تهران) و شهرستانهای دماوند (آبعلی، مهرآباد، ابرشیوه، تاررود، جمع آبرود) پاكدشت (شریف آباد، كریم آباد، جمال آباد، حصارامیر، فرون آباد و فیلستان) ورامین، (بهنام عرب جنوبی، بهنام وسطی جنوبی، بهنام پازوكی جنوبی، بهنام وسطی شمالی) قرچک (قشلاق جیتو ،ولی آباد) پیشوا (پیشوا ،عسگریه ،جلیل اباد ،طارند بالا)و فیروزكوه، (حبله رود، قزقانجای، پشتكوه، شهرآباد و دوبلوك) و شمیرانات (رودبارقصران، لواسان بزرگ، لواسان كوچك) وپردیس (گل خندان ،کرشت ،جاجرود وسعید آباد) میباشد.